本实用新型公开了一种中深层地热能换热器，包括供热站、供热加压机构、回水加压机构、供热管道、回水管道和加热泵机构，所述加热泵的输入端与供热站管道连接，用于对所述供热站输出的水通过供热加压机构加压后经加热泵机构加热后输送至供热管道，同时在回水管道上设置回水加压机构，将回水管道内水加压后输送至加热泵，用于提高供热管道和回水管道的水流速度，减少热量流失。本实用新型在采暖初期，加热泵入口温度高于45摄氏度，隔离加热泵，加热泵入口温度降至45摄氏度以下，可以隔离加热泵，可以降低运行成本，保护热泵机组，并且设置加压组件，提高水流速度，降低水流时间，防止热水在管道内流失。