本实用新型公开了一种快速电穿孔转染仪，包括机体和电极杯，机体一侧设置有电极基座，电极基座上中央处开设有多个电极插槽，电极基座一侧设置有透明上盖，电极杯两侧均固定设置有电极杯金属触点，电极杯内部底端开设有电极槽。本实用新型中在电极基座上设有两个电极插槽，即可安装两个电极杯，可一次性操作两个电极杯，增大设备同时转染的细胞量，通过机体内部设置的可编程PLC，采用特殊设计的电转染程序，每个转染程序都包含两个步骤，每个步骤包含“+”向和“‑”向两个电极步骤，每个程序都包含两个步骤，第一个步骤，可有效提高细胞穿孔率。第二个步骤可协助目标分子进入细胞，有效提高转染效率。