本实用新型涉及一种电穿孔盒筒和一种电穿孔系统。在一些实施例中，电穿孔盒筒包括：电穿孔室，其由伸长主体限定；第一电极，其处于近端末端处；和第二电极，其处于室的远端末端处。本实用新型的电穿孔系统包括一个或多个组件，其包括：脉冲发生器、用于放置流通式或单次使用式电穿孔盒筒的舱、用于存储细胞的组件、冷却和预冷却机构、具有用于保持和布置电穿孔系统以及试剂组件的舱的可移除地插入的模块化壳体、用于将样品移动通过该系统的一个或多个泵、以及处理器和控制器。