本发明提供高频双极性不可恢复电穿孔系统，所述穿孔系统包括双极性穿孔模块、数据采集模块以及穿孔调整模块；所述双极性穿孔模块包括双极性脉冲发生器以及脉冲控制单元，所述脉冲控制单元分别与穿孔调整模块和双极性脉冲发生器相连接，所述脉冲控制单元用于接收穿孔调整模块的调整指令，并根据调整指令控制双极性脉冲发生器运作；所述数据采集模块包括细胞特征预采集单元、脉冲参数获取单元以及细胞治疗参数采集单元；所述细胞特征预采集单元用于对治疗前的细胞基础特征进行采集，本发明能够基于细胞不同层级的基础特征以及治疗效果来变换脉冲输出参数，以解决现有的高频穿孔治疗效果较差的问题。