本实用新型涉及一种除废液机构及核酸提取装置。该除废液机构包括移动机构及吸液件，吸液件可拆离地连接于移动机构，移动机构用于带动吸液件移动至吸液位置，吸液件包括吸液材料；当移动机构带动所述吸液件移动至吸液位置时，吸液材料的至少部分位于反应管内的废液中。如此，移动机构带动吸液件移动至吸液位置，此时吸液件插入至反应管内，并且吸液材料的至少部分位于反应管的废液中，从而利用吸液材料吸附废液。与现有技术中采用可拆卸枪头和移液泵进行吸液注液的方式相比，本申请中的除废液机构采用吸液材料对废液进行吸附的方式来达到移除废液的目的，对废液不产生冲击，避免了气溶胶的产生，不存在因气溶胶积累而导致的污染风险。