本实用新型公开了一种兽医用医疗器械清洗装置，涉及到兽医医疗设备技术领域。包括顶盖，所述顶盖的底端固定设置有清洁箱，所述顶盖的一侧固定设置有第一电机，所述第一电机的输出杆端固设置有第一主动齿轮，所述第一主动齿轮的一侧啮合设置有第一从动齿轮，所述第一主动齿轮与所述第一从动齿轮中心均固定设置有短转轴，两个所述短转轴的外表面阵列设置有短毛刷，两个所述短转轴的下方设置有传送装置，所述传送装置的一侧固定设置有收纳箱，所述收纳箱远离所述清洁箱的一端固定设置有挡板，所述传送装置的下方设置有两个清洁装置。有益效果：有效地节省人力物力，提高了清洁效率，加大清洁力度，进而提高清洁效率，使得医疗器械被清洗得更干净。