本实用新型公开了一种制药用批量瓶塞压装装置，涉及制药装置技术领域，包括压装装置主体，所述压装装置主体的上表面焊接有压装仓，所述压装仓的内部设置有瓶塞压装机构，所述瓶塞压装机构的下方设置有与压装装置主体的上表面固定连接的药瓶固定机构，所述药瓶固定机构包括有电机、丝杆、移动架一、移动架二和柔性保护套。本实用新型通过辅夹瓶器和主夹瓶器配合，将药瓶夹紧，再由柔性保护套承接药瓶的压力，对橡胶夹芯和弹力球进行挤压，使得柔性保护套与药瓶充分接触，增加药瓶固定时的平稳性与摩擦力，避免了常规压装装置在进行药瓶的固定时，由于药瓶规格不一，难以对药瓶进行平稳的固定的问题，提高了瓶塞的压装效率。