本实用新型涉及一种模块化底泥原位修复功能毯，自上向下包括净化层、隔离层和曝气层，所述净化层设有网状基底，所述基底上悬挂人工水草，所述隔离层由土工织物铺设成，所述曝气层设有多个竖直向下伸出曝气管，本实用新型还涉及一种底泥原位修复系统，由多个所述模块化底泥原位修复功能毯整齐排列构成。本实用新型可快速对河道底泥进行原位覆盖，通过曝气结合生物修复技术削减底泥中的污染物，减少底泥对上覆水的影响。所述底泥原位修复系统采用模块式结构，可以根据河道的长度和宽度灵活选择所述模块化底泥原位修复功能毯的用量，适用范围广，施工快速方便，当底泥修复完成后可以将修复系统或修复功能毯就地取出，再次投入到其他河段中循环使用。