本实用新型公开了一种内生真菌发酵液的过滤装置，包括固定支架，置于固定支架上的可调节固定夹、三段式过滤筒、滤筒顶端的盖子、第一段为平底型多孔滤筒、置于平底型滤筒上的滤纸、二段滤筒为抽滤筒、与抽滤筒相连的真空泵、二段过滤筒中置翻转隔层板、三段为嵌套式斜口过滤筒、置于滤筒口处的滤膜、与滤筒相连的导流闸阀、闸阀下的插片式滤膜、用于盛放滤液的容器。本实用新型用于内生真菌发酵滤液的菌丝体、孢子和滤液的分离，减少过滤过程中杂菌的污染和滤液针筒水系滤膜过滤时孢子易堵塞和过滤效率低的问题。该装置构造简单且易于操作，成本较低，效果显著，无需后期处理，实用性较强。