本发明涉及植物培育技术领域，公开了耐盐碱番茄叶内生菌，所述耐盐碱番茄叶内生菌命名为李斯特拟诺卡氏菌BFY2‑1，保藏于中国典型培养物保藏中心，保藏地址为湖北省武汉市武昌区八一路299号，保藏编号为CCTCC M 20211324，保藏日期为2021年10月26日；还公开了耐盐碱番茄叶内生菌的筛选纯化方法、发酵液的制备方法及应用。本发明筛选出来的菌株具有耐盐碱功能，喷施BFY2‑1菌株发酵液能够促进盐碱环境中番茄的生长，当BFY2‑1菌株发酵液的OD值为0.1时，该BFY2‑1菌株将受盐碱胁迫的番茄种子的发芽率提高了14.3％；盆栽实验中对番茄植株叶面喷施该BFY2‑1菌株发酵液，番茄的株高提高了13％，鲜重提高了17％，本发明的BFY2‑1菌株在大棚设施番茄的生产方面具有很好的应用前景。