本实用新型涉及生物制药技术领域，且公开了一种生物制药发酵液预处理装置，包括发酵结构，所述发酵结构底部设置了有清理结构，所述发酵结构顶部固定连通有过滤结构，所述发酵结构包括一号电机和发酵桶，所述一号电机底部输出轴固定连接有搅拌杆，所述搅拌杆底端贯穿发酵桶顶部并延伸至发酵桶内部。该生物制药发酵液预处理装置，一号齿轮与二号齿轮相互啮合，螺纹杆位于散热盒外侧的部分设置了螺纹板，在螺纹板的底部设置了清理板，底座设置了四个，两个为一组，清理板位于两组底座中间，螺纹杆外侧与底座活动连接，二号电机启动，带动一号齿轮转动，使得螺纹杆和二号齿轮同时转动，带动清理板运动，对装置的底部进行清理。