本实用新型公开了一种生物基助剂生产废水处理系统，包括经管道相连的前处理单元、预处理单元、生化处理单元、物化处理单元和污泥处理单元：所述前处理单元包括经管道依次相连的格栅井、破乳隔油池、废水调节池，以及经管道依次相连的高浓收集池、批处理系统；所述预处理单元包括与废水调节池经管道依次相连的铁碳反应池、混凝沉淀池和中间水池；所述生化处理单元包括与水解酸化池经管道依次连接的厌氧池、好氧池和二沉池；所述物化处理单元包括管道相连的混凝气浮池、外排监护池及标准计量井；所述污泥处理单元包括污泥池以及板框压滤机。本实用新型具有能够极大提高污水处理效率，确保出水水质稳定达标的特点。工艺成熟稳定，经济适用，安全。