本实用新型提供了一种带密封结构的汽车控制器，包括上壳体、下壳体和电路板，所述上壳体与所述下壳体固定连接且内部形成容置腔，所述电路板设置于所述容置腔内，所述电路板设有若干接线插座，还包括密封件，所述密封件设有水平设置的第一密封部和若干竖直设置的第二密封部，所述第一密封部与所述第二密封部固定连接，所述第一密封部设于所述上壳体与所述下壳体之间的连接处，所述第二密封部与所述接线插座相对应，所述第二密封部套设于所述接线插座。本实用新型的密封结构安装操作简便，能够有效提高生产效率，同时也能够提高安装的密封性，进而提高控制器的防水性能。