本实用新型公开了一种正畸钳钻孔机构，包括机架，所述机架顶部固定安装有钻孔装置，所述机架底部固定连接有下箱体，所述机架顶部设有在竖直方向上运动的上箱体，所述上箱体和下箱体之间通过柔性连接件连接，所述上箱体内部固定连接有隔板，所述隔板上设有固定正畸钳的夹持装置。本实用新型中，由于正畸钳的钳头固定在隔板上，隔板与上箱体顶部开口端距离合适，在钻孔过程中，飞屑被上箱体四周竖直端遮挡，避免飞屑四溅的问题，飞屑落在隔板上，待取下钻孔后的钳头后，废屑通过隔板上通过落入下箱体内。