本实用新型公开了一种自动化细胞培养基用分装装置，涉及培养基分装技术领域，为解决现有技术中的现有的培养基在生产装配时需要对不同尺寸的培养基进行分类，这类操作大多是由人工配合机械完成，无法实现全自动化的分装操作的问题。所述分装基座的上方设置有分装轴柱，且分装轴柱与分装基座电性连接，所述分装轴柱的外表面设置有分装盘架，且分装盘架有多个，所述分装基座的一端设置有输出摇杆套组，且分装基座的另一端设置有输入摇杆套组，所述输出摇杆套组和输入摇杆套组均包括电源底轴、垂直轨杆和分装摇臂，且电源底轴与垂直轨杆电性连接，所述分装摇臂一端的下方设置有电控夹盘，且电控夹盘与分装摇臂通过螺钉连接。