本实用新型属于包装设备技术领域，且开了一种自动化无菌细胞培养基分装装置，包括基座，所述基座的一侧安装有控制器，且基座的顶部安装有第一支撑架，所述第一支撑架的内部对称转动连接有两个第一连杆，两个所述第一连杆上均套设有第一传动辊，两个所述第一传动辊之间套设有第一输送带，所述第一支撑架的一侧安装有第一电机，其中一个所述第一连杆延伸至第一支撑架外部的一端与第一电机转动连接，本实用新型通过第一电机带动第一传动辊转动，通过第二电机带动第二传动辊转动，从而让第一输送带和第二输送带带动包装箱和培养基移动，让装置便于自动输送包装盒和培养基，大大降低了使用者的工作强度，提高了使用者的工作效率。