本发明提出了一种全自动制剂细胞无菌分装工作站，包括：台面，其上设置有密闭的隔离室；冻存袋放置机构包括自动转盘，自动转盘上放置有若干冻存袋；灌装封口机构包括固定座，固定座的顶端设置有固定架，固定架的底部设置有注液针头，用于对冻存袋进行注液，固定座的顶面设置有封口器，用于对注液后的冻存袋进行封口；传输机构包括传送带，用于对灌装封口后的冻存袋进行运输；机械手臂分别和冻存袋放置机构、灌装封口机构、传输机构相接触；控制系统，包括操控面板和操控按钮，借此，本发明实现了在无菌环境下对冻存袋进行自动拿取、自动灌装封口以及自动运输的效果，不仅提高了工作效率，同时也降低了在冻存袋灌装的过程中被污染可能性的优点。