本实用新型公开了一种自动反冲洗控制器，包括底壳、第一连管和第二连管，所述的底壳的顶端安装有内壳，且内壳的顶端安装有端壳，同时底壳的轴心线、内壳的轴心线和端壳的轴心线均在同一条竖直直线上；所述的底壳的内部安装有隔板，且隔板的一侧开设有通槽，且隔板的另一侧顶部安装有隔水管；所述的通槽与内壳的内部相连通；本实用新型，设置有压力表和主控模块，通过压力表对过滤管进水端的内部压力进行实时监测，并将监测结果定时发送给主控模块，当滤芯需要进行冲洗时，穿过滤芯的水流速度会降低，导致滤管内部的进水端压力增加，当压力数值超过阈值后，通过主控模块对控制电机、连通阀和电磁阀同步控制即可完成冲洗。