本实用新型公开了一种牙科废水高效消毒设备，包含蓄水箱，蓄水箱上设有液位感应器、第一送水管和第一磁力泵，第一磁力泵与蓄水箱和第一送水管相连接，蓄水箱一侧设有消毒模块，消毒模块与蓄水箱之间设有臭氧发生器和净水箱，臭氧发生器上设有送气管，送气管上设有第一单向阀，净水箱上设有第二送水管，第二送水管上设有第二单向阀和第二磁力泵，第二送水管连接净水箱和送气管；本实用新型结构简单，对牙科医疗废水可以进行快速的消毒，同时本消毒设备采用了环保的消毒方式，符合环保要求。