本实用新型公开了一种柴油发动机控制系统，包括箱体，所述箱体内腔的两侧均滑动连接有移动箱，所述移动箱的顶部栓接有柴油发动机控制装置，所述箱体的内腔设置有顶出机构，所述箱体左侧的顶部栓接有支撑板，所述支撑板的顶部栓接有第一安装板，通过第一旋转轴、主动锥齿轮、从动锥齿轮、丝杆、螺纹套和活动板的配合，便于使用者将柴油发动机控制装置进行收纳和移出，从而在不使用柴油发动机控制装置时，对柴油发动机控制装置进行保护，防止柴油发动机控制装置与其他物体碰撞导致损坏，导致成本增加，同时防止使用者误操作柴油发动机控制装置，影响柴油发动机的正常使用，通过盖板和第一弹簧的配合，对箱体进行封盖。