本实用新型公开了一种生态灌区沟塘污染物净化系统，涉及生态环境治理技术领域。包括沟渠主体，所述沟渠主体的前后内壁之间靠近左侧边缘位置设置有格栅，且格栅的右侧面固定安装有导向板，所述导向板右侧的沟渠主体前后内壁之间设置有挡板，所述沟渠主体的前后内壁位于挡板的右侧安装有闸门，所述闸门右侧的沟渠主体前后内壁之间设置有过滤机构，所述过滤机构右侧的沟渠主体前后内壁之间设置有爆气机构，所述爆气机构右侧的沟渠主体内壁上设置有种植机构。本实用新型通过多级过滤、沉淀、爆气和净化，能够有效的对沟渠主体内水资源进行净化，且净化效果更佳，同时各个组件相互配合，在灌溉时不会影响水流流动，使用更加方便。