本实用新型公开了一种自动筛选种子用筛选机，包括机体，所述机体的顶部连通有进料斗，所述机体内腔的顶部并与进料斗的底部连通设置有分离罩，所述分离罩内腔的两侧均固定安装有分离板，所述分离板的底部设置有隔板，所述隔板的背面固定安装有定位杆，所述定位杆的端面与分离罩的内壁固定安装，所述机体的内腔并位于分离罩的下方活动安装有第一筛网。本实用新型通过设置两个筛网，可对种子进行分级筛选，有效的提高对种子的筛选质量，而且机体的内部增加吸附网，可对筛选时产生的灰尘进行处理，并减少灰尘向外飘散的几率，防止灰尘在室内飘散影响环境，避免对操作人员健康造成影响，并提高了对种子的筛选效率。