本实用新型涉及光伏行业技术领域，尤其涉及一种光伏行业废水的深度除氟系统。其技术方案包括：加工箱、储存箱和净化组件，加工箱内部安装有内衬板，内衬板内侧安装有防腐板，加工箱底部两侧通过螺栓安装有两组传输管，传输管底部安装有储存箱，储存箱内部安装有过滤网，加工箱一侧安装有净化组件，净化组件包括净化器、连接管、防护箱、抽风机，净化器的输出端安装有连接管。本实用新型通过防腐板可对加工箱内壁进行保护，避免含有大量氟元素的废水对加工箱内壁造成腐蚀现象，防止装置长时间使用后导致加工箱内壁变薄，降低了加工箱内壁变薄对后续加工的影响，从而延长了装置的使用寿命，降低了装置的维修负担。