本实用新型公开了一种医疗废水处理一体化系统，包括预处理阶段、深度生化反应阶段以及用于控制预处理阶段、深度生化反应阶段的设备房，预处理阶段包括化粪池，化粪池的左端设有进水口，化粪池的右端通过管道连接的格栅井；所述格栅井右端通过管道连接有调节池；调节池底部设有污水提升泵；并且所述调节池一体成型有污泥池，本实用新型为地埋式，节省构建单元的占地面积同时高度集成，采用循环式水解酸化池、接触氧化池以及膜滤池相结合，对水量、水质有较强的耐冲击能力，循环式水解酸化池提高污水的可生化性、提高处理效率，同时生物填料的吸附、硝化反硝化作用与膜滤池最终的固液分离，高效去除医疗废水中的有机物，实现脱氮除磷的目的。