本实用新型涉及磷虾加工的技术领域，特别是涉及一种南极磷虾肽高效发酵装置，其能够有效提高发酵效果，并且保持适合的温度进行反应，提高实用性；包括反应仓、密封盖、第一连接架、第一转轴、第一传动轮、减速机、传动带和驱动电机，反应仓底部的左前侧、左后侧、右前侧和右后侧均设置有支架，反应仓的内部设置有反应腔，反应腔的顶部左侧连通设置有进料管，密封盖螺装套设在进料管的顶部输入端外侧，反应腔的右端下侧连通设置有出料管，出料管上设置有控制阀，反应仓的底部设置有加热器，反应腔的底部设置有第一轴承座，反应腔的顶部设置有第二轴承座，第一连接架的底端设置有多组连接杆，多组连接杆的底端均与反应仓的顶端连接。