本实用新型公开了一种除藻船，包括：打捞船，所述打捞船行驶在水面上；收集铲，所述收集铲设置在所述打捞船的前端，用于收集水面上的蓝藻；浮子水泵，所述浮子水泵连接在所述收集铲上；气浮分离罐，所述气浮分离罐设置在所述打捞船上，所述气浮分离罐上安装有灭活装置和分离装置，所述浮子水泵将收集铲内收集的含有蓝藻的水通过输送管输送至所述气浮分离罐内，所述灭活装置对气浮分离罐内的蓝藻进行灭活，所述分离装置将气浮分离罐内灭活后的蓝藻分离出气浮分离罐并收集在打捞船上。本实用新型清理蓝藻的速度快，且处理后的蓝藻置于蓝藻舱内，不会对环境造成污染，同时不会对人体产生危害。