本实用新型属于量子计算技术领域，提供一种低温离子阱系统，包括：底座、原子发生器、离子阱装置及盖板，所述离子阱装置罩装于所述底座，所述盖板封装所述离子阱装置，所述原子发生器安装在所述底座并与所述离子阱装置同轴；所述原子发生器具备用于原子发射的发射口，所述发射口正对所述离子阱装置的囚禁通道；所述离子阱装置产生囚禁电场，所述囚禁电场电离原子并将离子囚禁在所述囚禁通道。结构紧凑，功能完善，可靠性高，能够满足量子计算的各种实验需求；热负荷低，降低了系统对于冷量的需求，实现了低温刀片形离子阱的功能一体化；规避了走线杂乱导致的短路、断路等问题，给离子阱量子计算机的产品化提供了必要条件。