本实用新型公开了一种双笼实验猴负压隔离器的双控安全负压主机，包括负压主机和猴笼隔离器，负压主机连接在猴笼隔离器上，负压主机内设置有若干个通风系统，通风系统包括新风机、排风机和过滤装置，新风机上设置有隔离器进风接口，排风机上设置有隔离器排风接口，过滤装置上设置有排风口，排风口穿过负压主机延伸至负压主机外，猴笼隔离器上设置有进风口和出风口，第一通风管一侧连接在隔离器进风接口，另一侧连接在进风口，第二通风管一侧连接在隔离器排风接口，另一侧连接在出风口，猴笼隔离器上设置有若干个监控摄像头。本实用新型通过将猴笼隔离器和负压主机设置成双层箱体结构，解决了占地面积大和猴笼内空气质量不好的问题。