本实用新型公开了一种湖泊浮游植物碳流调控装置，包括主箱，所述主箱的顶部固定连接有冲刷装置，所述冲刷装置包括水箱，所述水箱内部的顶部固定连接有第二固定架，所述第二固定架的内部固定套接有水泵，所述水箱的顶部固定连接有第一固定架，所述第一固定架的顶部固定套接有第一电机，所述第一电机的输出轴通过第一传动装置与转轴传动连接，所述转轴的外侧活动连接有传送带，所述传送带的内侧活动连接有输水管，所述输水管的一端固定连接有喷头，通过喷头对第二固定架进行冲洗使浮游植物进入设备内部，防止有部分浮游植物未完全进入设备内而对测试结果造成影响，提高了设备测量结果的精准度。