本实用新型公开了一种反渗透膜组在线清洗系统，主要涉及反渗透膜组清洗领域。包括连接管路、膜组控制机构和清洗机构，连接管路包括原水管道、浓水管道和透过水管道，膜组控制机构包括反渗透膜组、截止三通阀、清洗三通阀和反冲三通阀，反渗透膜组上设有与各个连接管路对应连通的原水口、浓水口和透过水口，多个膜组控制机构并联在连接管路上。本实用新型的有益效果在于：该装置通过对单个反渗透膜组进行控制，能够在不妨碍其它反渗透膜组的情况下，对单个反渗透膜组进行化学冲洗。能够将清洗液进行加热，加快清洗液与污染物之间的反应速度。通过三通阀的使用，提高了管道的利用率，简化管道之间的连接，便于自动化清洗。