本实用新型涉及泵体密封技术领域，尤其涉及一种偏心泵主轴套与壳体的密封结构。包括壳体，所述壳体上设有滑槽，所述壳体的内部设有主轴套和偏心轴，所述主轴套设置于偏心轴的外侧，所述偏心轴转动时，带动主轴套沿着壳体的内侧面做往复摆动，所述主轴套上设有导向柱，所述导向柱的一端与主轴套连接，所述导向柱的另一端位于滑槽内，所述主轴套的外侧面上设有密封件，所述主轴套往复摆动时，所述密封件与壳体的内壁切合密封。本技术方案用以解决现有技术中由于主轴套和壳体之间的密封效果不佳，使高压腔和低压腔在主轴套往复运动的过程中连通，造成对介质的运输效果变差的问题。