本实用新型涉及蒸汽灭菌器技术领域，且公开了一种微生物灭菌用蒸汽灭菌器，包括加热室，所述加热室的顶部设有灭菌室，所述灭菌室内腔底部的中部通过电动伸缩杆连接有物体放置框，所述灭菌室顶端的一侧设有回流管，所述回流管的另一端延伸至加热室内，所述灭菌室的顶部设有与物体放置框适配的分隔室，所述分隔室的底部设有开合门结构，所述分隔室的顶部设有密封盖。该微生物灭菌用蒸汽灭菌器，通过开合门结构的设置，可以把分隔室的内腔与灭菌室的内腔分隔开，使用者在取出灭菌后的物体时，灭菌室的内腔不会与外界接触，可以有效的降低灭菌室内的热量损失，便于该灭菌器的继续使用。