本实用新型公开了一种小型二级精密除菌过滤器，它包括一级过滤器和二级过滤器，一级过滤器底部的出料口与二级过滤器顶部的进料口固定连接，一级过滤器包括过滤器罐体、滤膜或滤纸和过滤器底部，过滤器罐体的内壁或外壁上设有第一保温夹套，过滤器罐体与过滤器底部通过法兰连接，过滤器底部的上部设有滤膜挡板，滤膜或滤纸位于滤膜挡板上；二级过滤器包括外筒体、滤芯、固定座和连接卡箍，外筒体套设在滤芯外部，外筒体的内壁或外壁上设有第二保温夹套，外筒体的下端固定设有连接环，连接环通过连接卡箍与固定座连接。本实用新型通过二级过滤，能够同时除菌和除杂质，精密过滤，大大提升了去除率，不会造成浪费，具有良好的过滤效果。