本实用新型公开了一种轨道小车运输控制系统，涉及轨道小车技术领域，为解决要安装多根运输轨道，增加了运输控制繁杂度，且多个小车同时运输时容易出现碰撞，使得小车运输效果不佳的问题。所述运输轨道上设置有活动轨道，且活动轨道与运输轨道活动连接，所述活动轨道设置在安装架的上方，所述运输轨道的上方设置有运输座，所述运输轨道的内侧设置有弧形轨，弧形轨设置有两个，所述运输座的内部设置有第二电机和驱动组件，且第二电机和驱动组件均与运输座通过螺钉连接，所述第二电机与驱动组件传动连接，所述运输座的下端设置有转动槽，转动槽设置有两个，两个所述转动槽的内部均设置有驱动轮，且驱动轮与驱动组件连接为一体结构。