本发明公开了一种工程认证与诊断分析系统，包括控制终端、认证系统和诊断分析系统，所述控制终端与认证系统实现双向连接，所述认证系统与诊断分析系统实现双向连接，所述诊断分析系统与控制终端实现双向连接，所述认证系统中包括数据上传模块、工程认证中心处理器、数据归类模块、数据处理模块、问因查找模块和数据反馈模块，本发明涉及工程认证技术领域。该工程认证与诊断分析系统，通过设置有认证系统，利用数据处理模块对庞大的数据进行处理，配合数据统计模块、数据分析模块和数据对比模块进行数据的统计、分析和对比，实现了对人员认证资料和数据的具体化处理，避免了数据混乱存在遗漏的情况，减少了认证错误的产生。