本发明提供一种利用蓝藻生产蓝藻型磷酸铵镁缓释肥的方法。该方法以蓝藻、农用级磷酸一铵、氧化镁粉为原料，通过调浆步骤、加氧化镁粉中和反应步骤、静置熟化步骤、干燥粉碎步骤，获得含一定量蓝藻的蓝藻型磷酸铵镁缓释肥，再通过后期加蓝藻混合、再次干燥粉碎等步骤，获得含蓝藻较高的蓝藻型磷酸铵镁缓释肥。发明提供了一种能高效、低能耗回收利用蓝藻有机资源的方法，该方法可彻底消除蓝藻存在的二次污染风险，还可为社会提供一种使用后无环境磷面源污染问题、有机质品质好、肥料缓释性好的环保型优质有机无机缓释肥。