本发明公开了一种用于碳酸二甲酯脱水的系统，所述系统包括进料泵、第一脱水塔、第二脱水塔、第一过滤器、冷却器和加热器；所述进料泵分别与第一脱水塔、第二脱水塔进料口连接，所述第一脱水塔、第二脱水塔的出料口分别与所述第一过滤器连接；所述加热器分别与所述第一脱水塔、第二脱水塔的进气口连接；所述第一脱水塔、第二脱水塔的出气口分别与所述冷却器连接。本发明的用于碳酸二甲酯脱水的系统，其脱水塔的结构合理，由于上下两端均设有空气分配器，可以延长分子筛的使用寿命，并且通过第一脱水塔和第二脱水塔的交替使用，大大提高了脱水效率。