本发明属于网络药理学和分子对接技术领域，公开了一种芪金合剂治疗肾结石的信息分析方法、计算机设备及应用，包括：利用多个数据库获取药物有效成分、疾病靶点，取两者交集基因；使用Cytoscape3.8.0软件构建中药‑成分‑靶点调控网络，将交集靶基因导入String数据库，构建PPI网络；对交集基因进行拓扑分析、GO和KEGG富集分析；将有效成分与核心基因分子对接，计算最低结合能，制作分子对接模型图。本发明通过网络药理学分析了黄芪‑金钱草两种药物的有效成分，以分子对接技术验证药物有效成分与肾结石靶点的结合，预测黄芪‑金钱草治疗肾结石潜在的作用机制和作用靶点，说明芪金合剂可以通过多靶点、多通路、多成分的途径治疗肾结石。