本发明公开了一种含并联谐波补偿装置的变换器拓扑结构及其控制方法，该结构包括两个三相半桥变换器，两个三相滤波电抗器以及两组直流母线电容。所述变换器包括主变换器和谐波补偿变换器。其中主变换器的每个桥臂包含一个上桥臂功率开关器件和一个下桥臂功率开关器件，谐波补偿变换器结构与主变换器相同。主三相电抗器与谐波补偿三相电抗器的另一端分别相连接，并与电机的三相绕组相接。本发明采用在原有低载波比电机系统的基础上，并联小容量、高开关频率的三相可控半桥电路，可以有效补偿电机三相绕组上的电流谐波，提高电机效率、较小电机发热等问题。