本发明涉及基于地层勘探的采空区灾害治理方法，首先进行补充勘探以确定各地层的厚度、埋深、密度和力学参数，以及关键层位置、破断距、采后位置和垮落带岩层原始厚度。基于不同位置处补充勘探钻孔勘探的基本顶位置，拟合出沿倾向的基本顶实际下沉值，然后计算基本顶理论下沉值，基于两者差值创造性的提出了采空区等效残余采高的概念，并基于条带开采理念认为采空区无需全区域处理，仅部分处理即可。创造性的结合关键层破断距和破断位置确定注浆区域位置以及注浆充填宽度，并给出了控制层的确定方式。基于此确定的注浆钻孔布置方案，可以减小钻孔施工量、注浆充填量，节约成本与时间。