本发明涉及PCR基因扩增技术领域，公开一种用于核酸现场变温扩增的PCR扩增仪及扩增方法，包括机壳、机盖、放样槽、放样板、管槽以及于管槽内放置的样品管，放样板于放样槽内自靠近机盖至远离机盖依次间隔设置有至少三个，放样板内部设置有加热管且放样板外部包覆有隔热层，样品管包括管体、管盖、于管体靠近管盖处设置的使管体内腔与外部连通的通气管以及于管体内密封升降设置的第一密封件，机盖和样品管之间设置有控制第一密封件升降的控制结构，管体底部设置有气压平衡结构，该用于核酸扩增的PCR扩增仪及扩增方法，在同一扩增仪中实现变性、退火和延伸三个步骤的同时，无需重复升温和降温，减少扩增时间且避免温度过冲，保证基因扩增的质量。