本发明公开了一种仿生疏水微柱阵列结构及其制备方法、液滴操控方法。所述仿生疏水微柱阵列结构包括硅胶基板以及阵列式设置在所述基板上的多个硅胶微柱；所述硅胶微柱一体成型在所述硅胶基板上，制备所述硅胶微柱的微通孔利用飞秒激光钻孔而成。本发明采用的是飞秒激光加工技术，制备流程简单，对周围无影响，清洁环保。在每一个激光脉冲与物质相互作用的持续期内，避免了热扩散的存在，在根本上消除了类似于长脉冲加工过程中的熔融区、热影响区、冲击波等多种效应对周围材料造成的影响和热损伤，将加工过程所涉及的空间范围大大缩小，从而提高了激光加工的准确程度，即运用飞秒加工决不会伤及无辜。