本发明公开了一种测定水体中叶绿素a含量的前处理方法。用水系微孔滤膜抽滤水样，滤膜经多次速冻与水浴后加入丙酮‑甲醇试剂，再经振荡和离心后完成前处理。振荡和离心所得上清液用丙酮‑甲醇试剂定容后，即可作为待测样品备用。该方法能够加快叶绿素a的溶解速度，并提高前处理操作中叶绿素a的萃取完全程度。同时还能降低丙酮试剂的使用量，避免有机试剂的挥发和损失。本发明实现了样品前处理的批量化操作，极大地提高了工作效率，节省工作时间，避免了现有技术中易出现的手动误差，最终提升测定结果的准确度，以及数据的稳定性与重现性。