本发明公开一种环保水性复膜胶及其制备方法，涉及水性胶粘剂技术领域。本发明环保水性复膜胶由原料二苯甲烷二异氰酸酯与聚丙二醇‑2000制备得到聚氨酯预聚体，由原料甲基丙烯酸十二氟庚酯、烯丙基丙基醚和甲基丙烯酸羟乙酯制备得到含氟抗水解嵌段共聚物，聚氨酯预聚体与含氟抗水解嵌段共聚物、修复阻燃剂固化后加水调节固含量得到该环保水性复膜胶。该复膜胶遇到火焰和热流后，修复阻燃剂能够形成致密的、有良好强度的炭层结构覆盖在聚氨酯碳链表面，阻止环保水性复膜胶的燃烧和受热，提高环保水性复膜胶的修复性能和阻燃性能；聚氨酯预聚体与含氟抗水解嵌段共聚物的固化物热稳定性、耐候性好，得到阻燃耐候、粘结力强的环保水性复膜胶。