本发明提供一种海洋水质监测及可疑船舶取证系统及方法，包括：设置在目标海域的海基监测浮标、设置在岸上的船舶拍摄取证装置以及地面服务器；所述海基监测浮标，用于检测获得目标海域的水质参数和溢油数据；所述船舶拍摄取证装置，用于获得目标海域的AIS船舶数据，并拍摄目标海域的可疑船舶视频数据；所述地面服务器，用于接收所述目标海域的水质参数和溢油数据，以及所述目标海域的AIS船舶数据和可疑船舶视频数据，并对目标海域的水质进行监测以及发出污染告警信息。本发明解决了现有监测系统无法根据水质监测数据对可疑船舶取证的问题，辅助有关部门确定造成海洋污染的可疑船舶，以对可疑船舶进行追责和治理，避免造成更严重的海洋污染。