本发明提供了用于新能源汽车的氢燃料电池电能输出控制方法和系统，其通过拍摄和分析汽车行驶过程的外部环境影像，确定当前行驶的路段是否为交通拥堵路段；当汽车当前行驶在交通拥堵路段时，根据汽车与其前方汽车之间的距离和前方汽车的行驶速度，确定汽车自身最高允许行驶速度，以此调整汽车的氢燃料电池电能输出量；最后根据汽车的实际负重信息，确定其可行驶距离，从而对适应性提示司机对汽车进行加气，其通过对新能源汽车的实际行驶环境和实际负重信息，调整内部氢燃料电池的串联状态以使氢燃料电池能够适应性地输出不同电量，这样能够优化氢燃料电池的电能输出效率和提升新能源汽车的行驶里程。