本发明提供一种页岩气水平井多级压裂的顺序优化方法、系统、电子设备及存储介质，该方法包括对水平井井筒进行分段压裂以形成多条垂直于水平井井筒的压裂段；采集目标页岩层中同一断层贯穿的多口水平井的信息，并将断层贯穿的水平井井筒划分为前序压裂部、贯穿压裂段以及后序压裂部；获取各水平井的贯穿压裂段所处的段位信息；判断各水平井的贯穿压裂段是否位于同一段位；根据判断结果选择相应的压裂方式依次对各水平井的前序压裂部、贯穿压裂部和后序压裂部完成压裂，且各水平井的贯穿压裂段进行同步压裂。本发明的压裂顺序优化方法可有效减小页岩气水平井由于断层滑移引起的压裂段丢段，有效的保证了页岩气水平井多级压裂施工的顺利进行。