本发明公开了一种综合抗逆贻贝的筛选方法，经过准备养殖系统、监测养殖环境，经监测合格后将贻贝放入养殖系统，通过外观形态和体重观察对贻贝进行首轮筛选后，再依次进行应激后摄食恢复速度、捕食者存在条件下贻贝足丝生长行为、自组织行为和呼吸代谢的筛选，选择优质的繁殖用贻贝亲本。本发明借助行为生理学方法，利用贻贝生长状态、应激后摄食恢复、反哺食行为、生理代谢与个体的能量储存和环境适应力密切相关设计科学合理的筛选方法，可以简单、快速且高效地得到抗逆性强、食欲强的健康贻贝，对于贻贝的可持续养殖具有重要意义。