本公开提供了一种车载电磁监测系统，包括：数据采集装置、主机以及监测车辆，其中，数据采集装置包括多个电磁数据采集探头；数据采集装置设置在监测车辆的车顶，主机设置在监测车辆的车内，数据采集装置与主机通信连接；监测车辆在预设的监测区域内移动；在监测车辆的移动过程中，每个电磁数据采集探头分别在对应的预设测量频率范围内测量环境电磁数据，并将环境电磁数据传输至主机；主机用于获取监测车辆对应的移动轨迹，并根据环境电磁数据以及移动轨迹生成监测区域内的电磁环境地图。可以在全频段范围内针对多种频率下的电磁场进行监测，具有更高的电磁监测效率，更好的电磁监测效果。