本发明公开了一种不锈钢医疗器械消毒设备，包括外壳，所述外壳内开设有工作腔，所述工作腔内设有切换机构，所述切换机构用于将消毒后的器械运输保存，所述切换机构包括固定设置在所述工作腔底壁的升降气缸，所述升降气缸上端动力连接有升降杆，所述升降杆上端固设有放置台，所述放置台上端滑动设有备用滤网，所述工作腔后侧内壁固设有啮合电机，所述啮合电机在所述工作腔后侧内壁上下分布，通过设置切换机构，可以实现对消毒后的器械自动运输且能够在无菌环境下保存起来，节省了人工的同时避免了对人体的伤害，提高了医疗效率。